RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ANKFN1Q8N957 763 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR2T3Q8NH03 318 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR52J3Q8NH60 311 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SPOCK2Q92563 424 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 KAT2AQ92830 837 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NELL2Q99435 816 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FBRSQ9HAH7 460 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DUXAA6NLW8 204 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 AGPSO00116 658 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 LINGO3P0C6S8 592 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ACVR2AP27037 513 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GDF10P55107 478 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 LNX2Q8N448 690 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR4C6Q8NH72 309 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ARMC5Q96C12 935 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DUSP26Q9BV47 211 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 Q9N2J8 555 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA2Q9UM82 520 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 DHRS12A0PJE2 317 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RGS20O76081 388 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CXCL12P48061 93 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SLC6A9P48067 706 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NTHL1P78549 312 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FBXO43Q4G163 708 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SH3GL2Q99962 352 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 IFT27Q9BW83 186 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF576Q9H609 170 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RARRES3Q9UL19 164 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR5K4A6NMS3 321 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NRP2O60462 931 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 UNGP13051 313 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SPIN4Q56A73 249 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FATE1Q969F0 183 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 U3KQV3 271 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 MID1O15344 667 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 HCN1O60741 890 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TCEA3O75764 348 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V1G2O95670 118 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CER1O95813 267 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 THEGLP0DJG4 465 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 HSD11B1P28845 292 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 CTSKP43235 329 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SERINC3Q13530 473 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PGLSO95336 258 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 AGR2O95994 175 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ACADLP28330 430 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RAB8AP61006 207 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 MYBPC3Q14896 1274 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL26Q53HC5 615 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 TTMPQ5BVD1 217 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 EMC10Q5UCC4 262 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf189Q5VU69 101 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 KRT74Q7RTS7 529 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRB-204ENST00000538708 SATL1Q86VE3 508 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms