RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAD23BP54727 409 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PER3P56645 1201 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUP107P57740 925 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNG2P59768 71 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PEX6Q13608 980 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP1A4Q13733 1029 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IL11RAQ14626 422 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COQ5Q5HYK3 327 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNF44Q7L0R7 432 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VRK2Q86Y07 508 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FADS6Q8N9I5 356 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR7D4Q8NG98 312 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR48Q8TAF3 677 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PHYHIPQ92561 330 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MTERF3Q96E29 417 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRRC46Q96FV0 321 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC35A4Q96G79 324 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TCTN2Q96GX1 697 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PBKQ96KB5 322 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIB1Q96RU8 372 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OLFM1Q99784 485 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNF208Q9H0X6 261 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPG21Q9NZD8 308 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAI1Q9UI46 699 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.94□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PBRM1Q86U86 1689 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A087WV48 116 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PRB8 838 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGAT4DA6NG13 374 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASB14A6NK59 587 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MARCH11A6NNE9 402 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 F8W036 122 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCXO43602 365 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VPS26AO75436 327 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAF5LO75529 589 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCNKO75909 580 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MMP3P08254 477 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 INSRRP14616 1297 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP6V1C1P21283 382 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PON1P27169 355 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEAD1P28347 426 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCTDP32321 178 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYP2C18P33260 490 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PHBP35232 272 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MC3RP41968 323 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC1A2P43004 574 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNJ3P48549 501 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GSSP48637 474 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NCKAP1LP55160 1127 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBE2G2P60604 165 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARF6P62330 175 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VSNL1P62760 191 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACTBL2Q562R1 376 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WSCD1Q658N2 575 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLD3Q8IV08 490 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms