RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 H3BMM5 538 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN3O60637 253 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LCKP06239 509 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PSKH1P11801 424 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MLNP12872 115 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CD36P16671 472 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GDI1P31150 447 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LIPEQ05469 1076 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CPA6Q8N4T0 437 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR4M2Q8NGB6 313 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NUAK2Q9H093 628 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PLK4O00444 970 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DSCR3O14972 297 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KCNJ13O60928 360 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 APOA1P02647 267 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 YES1P07947 543 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ESCO2Q56NI9 601 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 BNIPLQ7Z465 357 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 STON2Q8WXE9 905 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SMARCD2Q92925 531 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DTLQ9NZJ0 730 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR7A10O76100 309 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ADH1CP00326 375 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TGFBR2P37173 567 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MATKP42679 507 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CUZD1Q86UP6 607 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 IRF7Q92985 503 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 APOL2Q9BQE5 337 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GDE1Q9NZC3 331 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 VPS4AQ9UN37 437 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 BEST1O76090 585 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MT-ND2P03891 347 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 APOA4P06727 396 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TTC23Q5W5X9 447 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.86□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MICU2Q8IYU8 434 aa9.86□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 MMP28Q9H239 520 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MMP27Q9H306 513 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MID2Q9UJV3 735 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0A0MRY4 1105 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEB16A2A368 324 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MEIOCA2RUB1 952 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJB5O75953 348 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 IL7P13232 177 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF250P15622 560 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CASP2P42575 452 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RFX2P48378 723 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR4D2P58180 307 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ITKQ08881 620 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CDK5R2Q13319 367 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GALNT3Q14435 633 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.86□□□□□ -0.83
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