RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CRADDP78560 199 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 TMED2Q15363 201 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 NR6A1Q15406 480 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PCID2Q5JVF3 399 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SPC24Q8NBT2 197 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CUTCQ9NTM9 273 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 DSCR3O14972 297 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CBX6O95503 412 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ONECUT2O95948 504 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 MMP11P24347 488 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 GRM7Q14831 915 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 NKG7Q16617 165 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
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HERC3-211ENST00000513325 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 TM9SF4Q92544 642 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 INPP5DQ92835 1189 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 FKBP10Q96AY3 582 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PANX3Q96QZ0 392 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SPSB2Q99619 263 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 P2RY12Q9H244 342 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 TREX1Q9NSU2 369 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CDC23Q9UJX2 597 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 NFS1Q9Y697 457 aa16.22■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 A1L4Q6 167 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 KRT87PA6NCN2 255 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ALOX12BO75342 701 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 NDUFS3O75489 264 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 C1orf105O95561 183 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ALBP02768 609 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ITGA3P26006 1051 aa16.21■□□□□ 0.19
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HERC3-211ENST00000513325 OR1D4P47884 311 aa16.21■□□□□ 0.19
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HERC3-211ENST00000513325 Q6ZS92 163 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 COX15Q7KZN9 410 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 NACC2Q96BF6 587 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 WDR54Q9H977 334 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.21■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 SOCS6O14544 535 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 KPNA5O15131 536 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 CTSVO60911 334 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 FKBP9O95302 570 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 DDAH2O95865 285 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 PSMB5P28074 263 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 GLRBP48167 497 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 RPS6KA1Q15418 735 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 CCNG2Q16589 344 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 CNSTQ6PJW8 725 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 CUZD1Q86UP6 607 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 LRRC6Q86X45 466 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 MPP5Q8N3R9 675 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-211ENST00000513325 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.2■□□□□ 0.18
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