RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 PSMA3P25788 255 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 IVDP26440 423 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 NPY2RP49146 381 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 PER3P56645 1201 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 MORF4L2Q15014 288 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 KCNMB4Q86W47 210 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 NXPE1Q8N323 547 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.167e-13■■■■■ 109.8
SIMC1-208ENST00000495423 ULK4Q96C45 1275 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 RAB17Q9H0T7 212 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.27■■□□□ 1.16
SIMC1-208ENST00000495423 CFAP99D6REC4 459 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 E2F3O00716 465 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 HCRTR1O43613 425 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 UMODP07911 640 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 VPS41P49754 854 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf54Q08AI8 447 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 SPARCL1Q14515 664 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 C1orf189Q5VU69 101 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 PHC3Q8NDX5 983 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 MARVELD3Q96A59 401 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 SNF8Q96H20 258 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 COPS8Q99627 209 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 APOL2Q9BQE5 337 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ERP44Q9BS26 406 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 IL22Q9GZX6 179 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 SRPK3Q9UPE1 567 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 CDYLQ9Y232 598 aa22.26■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 HEATR9A2RTY3 570 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 MASP2O00187 686 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 RPA4Q13156 261 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 CBLBQ13191 982 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ZIC1Q15915 447 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 CYP2A13Q16696 494 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 IGFL2Q6UWQ7 119 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 NACC2Q96BF6 587 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 XKR8Q9H6D3 395 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 BFARQ9NZS9 450 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ICKQ9UPZ9 632 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.25■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 AGPSO00116 658 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 LRRTM2O43300 516 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 RAD51CO43502 376 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 PRF1P14222 555 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ADRA1DP25100 572 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 PDHA2P29803 388 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 SNX20Q7Z614 316 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 HGH1Q9BTY7 390 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 WHRNQ9P202 907 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 TACC2O95359 2948 aa22.24■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 MAGEB16A2A368 324 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 MROH6A6NGR9 719 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 EDN3P14138 238 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 UGT2B7P16662 529 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 ITGALP20701 1170 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 MAGEA3P43357 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 FOXL2P58012 376 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 PRKG2Q13237 762 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 OLIG2Q13516 323 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 C8orf74Q6P047 294 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.23■■□□□ 1.15
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM73Q86UV7 250 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms