RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 C17orf77Q96MU5 243 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZNF583Q96ND8 569 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PRAM1Q96QH2 718 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 INTS14Q96SY0 518 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ABCG8Q9H221 673 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CDH7Q9ULB5 785 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HYKKA2RU49 373 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OOEPA6NGQ2 149 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MEIS2O14770 477 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CELF2O95319 508 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OLFM2O95897 454 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 IGHDP01880 384 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 AMD1P17707 334 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PTPN3P26045 913 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLC12A3P55017 1021 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ERVFC1-1P60608 527 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RBPJQ06330 500 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ACCSLQ4AC99 568 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DET1Q7L5Y6 550 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 NFE4Q86UQ8 179 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 COMMD2Q86X83 199 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RNF128Q8TEB7 428 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SGK494Q96LW2 274 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 IWS1Q96ST2 819 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 KRT23Q9C075 422 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANO10Q9NW15 660 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 VPS18Q9P253 973 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TRIM77I1YAP6 450 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 KRT36O76013 467 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TPM2P07951 284 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 INHBAP08476 426 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 RAB40ALP0C0E4 278 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ACP2P11117 423 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A6P31641 620 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CTNNB1P35222 781 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CASP3P42574 277 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CRKLP46109 303 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 NR2C2P49116 596 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 THOP1P52888 689 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 LIMK1P53667 647 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 PRKCZQ05513 592 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 MZT1Q08AG7 82 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 GALNT17Q6IS24 598 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CASC1Q6TDU7 716 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TMEM270Q6UE05 265 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 OLFM4Q6UX06 510 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 MCM10Q7L590 875 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 NEK11Q8NG66 645 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TEKT1Q969V4 418 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 DOCK7Q96N67 2140 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 IL19Q9UHD0 177 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ITGA11Q9UKX5 1188 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PPQ1 181 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PRB8 838 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CCDC188H7C350 402 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 NOL3O60936 208 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CRCPO75575 148 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 MOCS3O95396 460 aa4.64□□□□□ -1.67
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