RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 B4DGG1 531 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 G3V2L1 256 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TK2O00142 265 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MATN2O00339 956 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TRIM13O60858 407 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SDC3O75056 442 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 EML2O95834 649 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 BPGMP07738 259 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SBK3P0C264 359 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 GIMD1P0DJR0 217 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 GLB1P16278 677 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 IMPDH1P20839 514 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 GRK2P25098 689 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 KCNC1P48547 511 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB4P48594 390 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RAB28P51157 221 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MPP2Q14168 576 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NR1D2Q14995 579 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SETDB1Q15047 1291 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 LIPMQ5VYY2 423 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SLCO6A1Q86UG4 719 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ARL14Q8N4G2 192 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NAT6Q93015 286 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RHBDF1Q96CC6 855 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 L3HYPDHQ96EM0 354 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PKP4Q99569 1192 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TRMOQ9BU70 441 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 IKZF3Q9UKT9 509 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 A8MT66 165 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 UBXN8O00124 270 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 DLX3O60479 287 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 KATNA1O75449 491 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 STK16O75716 305 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SLC16A8O95907 504 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PKLRP30613 574 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PNLIPRP1P54315 467 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 HERVK_113P63132 956 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 GRB7Q14451 532 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NAA25Q14CX7 972 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PCLAFQ15004 111 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NR0B2Q15466 257 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PFKFB4Q16877 469 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ATG16L1Q676U5 607 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 AGTRAPQ6RW13 159 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 AMIGO1Q86WK6 493 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MARCH9Q86YJ5 346 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 OR56A3Q8NH54 315 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 LCN9Q8WX39 176 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SMPDL3AQ92484 453 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MIPEPQ99797 713 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 HGH1Q9BTY7 390 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ERVK-6Q9BXR3 956 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CD244Q9BZW8 370 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 IL21RQ9HBE5 538 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 WWOXQ9NZC7 414 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PADI4Q9UM07 663 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 K7EPI3 171 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 KLF11O14901 512 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NPHS1O60500 1241 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCNDBP1O95273 360 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GUCA1CO95843 209 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PRB1P04280 392 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NEFHP12036 1026 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CHN1P15882 459 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HRH2P25021 359 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 IMPA1P29218 277 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.1 ms