RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 STX2P32856 288 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 STAT5AP42229 794 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 MAGEA4P43358 317 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CDKN2DP55273 166 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ITGA1P56199 1179 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 MC1RQ01726 317 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 NAB1Q13506 487 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 GPR19Q15760 415 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 RELL1Q8IUW5 271 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 GPR135Q8IZ08 494 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 MCOLN3Q8TDD5 553 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 VPS39Q96JC1 886 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 IL17FQ96PD4 163 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 NRTNQ99748 197 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CPNE1Q99829 537 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 SLC12A9Q9BXP2 914 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 POPDC3Q9HBV1 291 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ENAMQ9NRM1 1142 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 KCND3Q9UK17 655 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PADI1Q9ULC6 663 aa18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 C21orf140B9A014 251 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TMEM150CB9EJG8 249 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 E7EQ34 232 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CCNDBP1O95273 360 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 RECKO95980 971 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 F7P08709 466 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PVRP15151 417 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ZNF28P17035 718 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 SSTR1P30872 391 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PNLIPRP1P54315 467 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 SLC7A5Q01650 507 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 GUCY2DQ02846 1103 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TLDC1Q6P9B6 456 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 WBP1Q96G27 269 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CCDC138Q96M89 665 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PARVBQ9HBI1 364 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PLCL2Q9UPR0 1127 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 FAM159BA6NKW6 160 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CMPK1P30085 196 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 GP5P40197 560 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 GABRA4P48169 554 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 AP1S2P56377 157 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ABATP80404 500 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 POU4F1Q01851 419 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CCSMST1Q4G0I0 132 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP40Q5TG30 622 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TRIM73Q86UV7 250 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CCDC25Q86WR0 208 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC22Q8N4W6 341 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 GALNT6Q8NCL4 622 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 OR2L3Q8NG85 312 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 OR2A1Q8NGT9 310 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PKP4Q99569 1192 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 LHX9Q9NQ69 397 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 SLC17A6Q9P2U8 582 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 A0A1W2PPV9 198 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ERVH48-1M5A8F1 160 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 TIAF1O95411 115 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 SLC16A8O95907 504 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 ITGB2P05107 769 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 LIFP15018 202 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 HIST1H2ADP20671 130 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 MAGP20916 626 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-203ENST00000474160 CCND1P24385 295 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms