RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCM3P25205 808 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS15P62841 145 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNASE1L3Q13609 305 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NAA25Q14CX7 972 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZIC1Q15915 447 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DEFB110Q30KQ9 67 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C16orf46Q6P387 395 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM20CQ8IXL6 584 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPNE9Q8IYJ1 553 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPATCH11Q8N954 259 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HMGCLL1Q8TB92 370 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PYROXD1Q8WU10 500 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CT55Q8WUE5 264 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EXTL1Q92935 676 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM60AQ9NP50 221 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDC23Q9UJX2 597 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLCL2Q9UPR0 1127 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MED16Q9Y2X0 877 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 E7ESA3 106 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO1CO00159 1063 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MEN1O00255 615 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NKX2-8O15522 239 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAV1Q03135 178 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MGAT5Q09328 741 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDC20Q12834 499 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGAP19Q14CB8 494 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP2A13Q16696 494 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BORAQ6PGQ7 559 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASB11Q8WXH4 323 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMPDL3AQ92484 453 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRFN5Q96NI6 719 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MIPEPQ99797 713 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPR87Q9BY21 358 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TWSG1Q9GZX9 223 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SAYSD1Q9NPB0 183 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLHL20Q9Y2M5 609 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KRT87PA6NCN2 255 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TP73O15350 636 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF749O43361 778 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AGXTP21549 392 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CMPK1P30085 196 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPS2Q13227 327 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBR1Q16650 682 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DUPD1Q68J44 220 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C8orf74Q6P047 294 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TLDC1Q6P9B6 456 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FIGLAQ6QHK4 219 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYTL1Q8IYJ3 562 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO1HQ8N1T3 1032 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DENND1AQ8TEH3 1009 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEC14L1Q92503 715 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZUFSPQ96AP4 578 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PKP4Q99569 1192 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLAC1Q9HBJ0 212 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC17A6Q9P2U8 582 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C9J4A7 227 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TUBB4AP04350 444 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 F8A1P23610 371 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GABRB3P28472 473 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNLIPRP1P54315 467 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLTPP55058 493 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDKN2DP55273 166 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM45BPQ6NSW5 357 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAPN12Q6ZSI9 719 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DSELQ8IZU8 1212 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJC22Q8N4W6 341 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC38A9Q8NBW4 561 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR2L3Q8NG85 312 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM45AQ8TCE6 357 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCOLN3Q8TDD5 553 aa19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms