RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436724.5

PTPRF-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 2,168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-207ENST00000436724 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 DPPA5A6NC42 116 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 CLGNO14967 610 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 MAP3K7O43318 606 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 NRP2O60462 931 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 ACP5P13686 325 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 CLDN2P57739 230 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 AP2B1P63010 937 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 LRP8Q14114 963 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 FBXO43Q4G163 708 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 IRGCQ6NXR0 463 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 USP30Q70CQ3 517 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 TRIM46Q7Z4K8 759 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 KBTBD6Q86V97 674 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 RNF148Q8N7C7 305 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 OR56A3Q8NH54 315 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 NUDT8Q8WV74 236 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 POM121BA6NF01 834 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 CEACAM5P06731 702 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 G6PDP11413 515 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SRFP11831 508 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SLC2A4P14672 509 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 GLULP15104 373 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 IRF8Q02556 426 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 XKR6Q5GH73 641 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 IL23RQ5VWK5 629 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 METRNLQ641Q3 311 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PDZD3Q86UT5 571 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 OXR1Q8N573 874 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SPDL1Q96EA4 605 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 ACPTQ9BZG2 426 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 ELOVL6Q9H5J4 265 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 USP34Q70CQ2 3546 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 H0Y8X5 98 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 MRASO14807 208 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 KMOO15229 486 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 RGS14O43566 566 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 KRT6AP02538 564 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 KRT6BP04259 564 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 LINGO3P0C6S8 592 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 TEAD1P28347 426 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 KRT6CP48668 564 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 MTTPP55157 894 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 TBPL1P62380 186 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 EMX2Q04743 252 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PRKG2Q13237 762 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 TDGQ13569 410 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 IMPG1Q17R60 797 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 IL17FQ96PD4 163 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 APOOQ9BUR5 198 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 FKBP6O75344 327 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 IL12AP29459 219 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 HLA-CQ95604 372 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 VPS33AQ96AX1 596 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 ACTL8Q9H568 366 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SLC28A1O00337 649 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SLC22A3O75751 556 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 BAG2O95816 211 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 DOC2AQ14183 400 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 AAGABQ6PD74 315 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 S100A14Q9HCY8 104 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 EBF1Q9UH73 591 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SNX6Q9UNH7 406 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRF-207ENST00000436724 POMPQ9Y244 141 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms