RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 FKBP10Q96AY3 582 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 REPS1Q96D71 796 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RTP4Q96DX8 246 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CTRCQ99895 268 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 REEP2Q9BRK0 252 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SNX12Q9UMY4 172 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NME7Q9Y5B8 376 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF233A6NK53 670 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CLIC2O15247 247 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 PMM2O15305 246 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CREG1O75629 220 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 GAP43P17677 238 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 HTR1BP28222 390 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ATICP31939 592 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEA1P43355 309 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 VAMP7P51809 220 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 LIMK2P53671 638 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ENPEPQ07075 957 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ALS2CLQ60I27 953 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1328Q86T90 577 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM135Q86UB9 458 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 GPBP1Q86WP2 473 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SFR1Q86XK3 245 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CEP97Q8IW35 865 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NEK11Q8NG66 645 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 THAP4Q8WY91 577 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ACCSQ96QU6 501 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RANBP9Q96S59 729 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 PANK4Q9NVE7 773 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 EHD3Q9NZN3 535 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC154A6NI56 674 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ARGFXA6NJG6 315 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 F2RL2O00254 374 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CETN3O15182 167 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MAPK13O15264 365 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RAD51BO15315 384 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 KCNN4O15554 427 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 B4GAT1O43505 415 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TNFP01375 233 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV2-30P06310 120 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 IVLP07476 585 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 P4HA1P13674 534 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MPGP29372 298 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNA3P32297 505 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 PTGER1P34995 402 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SGSHP51688 502 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 HK3P52790 923 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SLC12A3P55017 1021 aa6.11□□□□□ -1.43
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