RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 IL17BQ9UHF5 180 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SERTAD3Q9UJW9 196 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 VWA7Q9Y334 891 aa24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 HCRTR1O43613 425 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SAT1P21673 171 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 STAT5AP42229 794 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GUCY2DQ02846 1103 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2A13Q16696 494 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF18AQ8NI77 898 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SMYD2Q9NRG4 433 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PADI1Q9ULC6 663 aa24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PCM1Q15154 2024 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 IGSF10Q6WRI0 2623 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GFYI3L273 518 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO1CO00159 1063 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB14O43829 449 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MT-ND3P03897 115 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 DLSTP36957 453 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 RGS4P49798 205 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SUSD1Q6UWL2 747 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC38A9Q8NBW4 561 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MNS1Q8NEH6 495 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGCLL1Q8TB92 370 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 OLFM1Q99784 485 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MIPEPQ99797 713 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CROTQ9UKG9 612 aa24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2A7P20853 494 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 F8A1P23610 371 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIA3P42263 894 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGEA4P43358 317 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGA1P56199 1179 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM45BPQ6NSW5 357 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FIGLAQ6QHK4 219 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJC22Q8N4W6 341 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PPFIBP2Q8ND30 876 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM45AQ8TCE6 357 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 LINGO1Q96FE5 620 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 LHX9Q9NQ69 397 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PPV9 198 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 KATNA1O75449 491 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CTSBP07858 339 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MSL3P1P0C860 447 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CTAGE8P0CG41 777 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FDXRP22570 491 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 GABRA4P48169 554 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PNLIPRP1P54315 467 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 GPX6P59796 221 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FCRL6Q6DN72 434 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR135Q8IZ08 494 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO1HQ8N1T3 1032 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2A1Q8NGT9 310 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 DLG3Q92796 817 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 E7EQ34 232 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 NKX2-8O15522 239 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF749O43361 778 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2B3O76000 313 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC16A8O95907 504 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TCN2P20062 427 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 IL2P60568 153 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 YBX1P67809 324 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 GPS2Q13227 327 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CT55Q8WUE5 264 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF480Q8WV37 535 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SMPDL3AQ92484 453 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MR1Q95460 341 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 EFHD1Q9BUP0 239 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms