RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 LRP8Q14114 963 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-204ENST00000425660 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-204ENST00000425660 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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