RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ST8SIA4Q92187 359 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NGLY1Q96IV0 654 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 KCNC2Q96PR1 638 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 OPA3Q9H6K4 179 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NYAP2Q9P242 653 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SULT1C2O00338 296 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HSDL2Q6YN16 418 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FUZQ9BT04 418 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LRRN3E7EW58 273 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TOXO94900 526 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CTBP2P56545 445 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GPR68Q15743 365 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ERFEQ4G0M1 354 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SLC29A1Q99808 456 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 KLQ9UEF7 1012 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ADAM10O14672 748 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PMM2O15305 246 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 OAZ2O95190 189 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TFP02787 698 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TSPAN8P19075 237 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GCAP28676 217 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ADORA2AP29274 412 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 BRCC3P46736 316 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGDIBP52566 201 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MTPNP58546 118 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 UGT8Q16880 541 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NIT2Q9NQR4 276 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DDIT4Q9NX09 232 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NFASCO94856 1347 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 H7C1Q1 480 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TGFB1I1O43294 461 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NFICP08651 508 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ULK3Q6PHR2 472 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM143Q96AN5 459 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GAREM1Q9H706 876 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PRH1P02810 166 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HTR1EP28566 365 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NNMTP40261 264 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PNPLA4P41247 253 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TWF1Q12792 350 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GRM3Q14832 879 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GRK1Q15835 563 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TTLQ8NG68 377 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 QRFPRQ96P65 431 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TTLL8A6PVC2 850 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MCIDASD6RGH6 385 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 BET1O15155 118 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LRCH4O75427 683 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 IRF9Q00978 393 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GBE1Q04446 702 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF7Q14155 803 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TRAM1Q15629 374 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ECM1Q16610 540 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms