RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406859.7

NRXN1-211, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 2,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-211ENST00000406859 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 A0A1B0GTL3 188 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CLCA1A8K7I4 914 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 B8ZZF3 427 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 E2F3O00716 465 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 WNT9AO14904 365 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NDUFS3O75489 264 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ADH1BP00325 375 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 OTCP00480 354 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 FGF1P05230 155 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 FABP3P05413 133 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PGRP06401 933 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CDK1P06493 297 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SLC2A4P14672 509 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CYP2A7P20853 494 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 TGFBR1P36897 503 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SCN1BQ07699 218 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ABHD18Q0P651 414 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NPRL3Q12980 569 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 KIAA0040Q15053 153 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 BCL7AQ4VC05 210 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CCNJQ5T5M9 372 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SPATC1Q76KD6 591 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CHPFQ8IZ52 775 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ZNF675Q8TD23 568 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NETO1Q8TDF5 533 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PYCR2Q96C36 320 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 RAD9AQ99638 391 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 COQ7Q99807 217 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SMOQ99835 787 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 TINF2Q9BSI4 451 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SLC22A4Q9H015 551 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ACTL8Q9H568 366 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 RUBCNLQ9H714 662 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 REEP1Q9H902 201 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 RASSF1Q9NS23 344 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 RNF19AQ9NV58 838 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SPASTQ9UBP0 616 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 MEIOCA2RUB1 952 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CCDC182A6NF36 153 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 OR51F1A6NGY5 319 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 WASH4PA8MWX3 477 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 M0R082 166 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 DPM1O60762 260 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SEMA3DO95025 777 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 EPOP01588 193 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CAPN1P07384 714 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CD9P21926 228 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 MAPK8P45983 427 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 IL2P60568 153 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 PLIN5Q00G26 463 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 TSPY1Q01534 308 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CXCL9Q07325 125 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 GPAT3Q53EU6 434 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 XKR4Q5GH76 650 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 MANEALQ5VSG8 457 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 STX19Q8N4C7 294 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 OR52E6Q96RD3 313 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 KCNH6Q9H252 994 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 SP110Q9HB58 689 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.05□□□□□ -1.28
NRXN1-211ENST00000406859 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms