RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 POM121BA6NF01 834 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ULK1O75385 1050 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 B3GALT4O96024 378 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 LYNP07948 512 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 NDUFV2P19404 249 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 CASP2P42575 452 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 DGKQP52824 942 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 CCNIQ14094 377 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 STARD3Q14849 445 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SDE2Q6IQ49 451 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ZNF480Q8WV37 535 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ACPTQ9BZG2 426 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 AIG1Q9NVV5 245 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 MRASO14807 208 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 NRP2O60462 931 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 EBLN1P0CF75 366 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ACP5P13686 325 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 GSTT1P30711 240 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 IGFALSP35858 605 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 MTTPP55157 894 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 GTF2H3Q13889 308 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 HERC3Q15034 1050 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 CCDC6Q16204 474 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ADA2Q9NZK5 511 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 KCNK6Q9Y257 313 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 DNAJA2O60884 412 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PSME3P61289 254 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ERVK-8P63133 956 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SGCGQ13326 291 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 OR2L2Q8NH16 312 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 FBXL8Q96CD0 374 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 WDR26Q9H7D7 661 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SLC22A2O15244 555 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 AP1G1O43747 822 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ACADLP28330 430 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ACTR3P61158 418 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 CDKL1Q00532 357 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SP140Q13342 867 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 XKR6Q5GH73 641 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 HMGB4Q8WW32 186 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 NEIL2Q969S2 332 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 ASF1AQ9Y294 204 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-202ENST00000393119 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 MGAT4DA6NG13 374 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SLC16A5O15375 505 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SEC22BO75396 215 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CATP04040 527 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TACR1P25103 407 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 DOC2AQ14183 400 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 PIGGQ5H8A4 983 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 OGFOD2Q6N063 350 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 AMZ2Q86W34 360 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 APIPQ96GX9 242 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms