RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HTR3DQ70Z44 454 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NCLNQ969V3 563 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PARVBQ9HBI1 364 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SERHLQ9NQF3 203 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ITM2BQ9Y287 266 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 H0YAE9 185 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 UGT2B4P06133 528 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MAPK8P45983 427 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RPS14P62263 151 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB103AP81534 67 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PON2Q15165 354 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 INAQ16352 499 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MPPE1Q53F39 396 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NEK5Q6P3R8 708 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NETO1Q8TDF5 533 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 NEURL2Q9BR09 285 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FUCA1P04066 466 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 IL7RP16871 459 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ITPKAP23677 461 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RCVRNP35243 200 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PIGAP37287 484 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PGS1Q32NB8 556 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CHST14Q8NCH0 376 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 APIPQ96GX9 242 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PPT2Q9UMR5 302 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 U3KQV3 271 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 H3BMQ9 156 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KRT6AP02538 564 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KRT6BP04259 564 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C1SP09871 688 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KRT6CP48668 564 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 HLCSP50747 726 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TLE2Q04725 743 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 COG8Q96MW5 612 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LYSMD1Q96S90 227 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ING2Q9H160 280 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CCL26Q9Y258 94 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 GNGT2O14610 69 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CREG1O75629 220 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 AOAHP28039 575 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 BCAP31P51572 246 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC14A1Q13336 389 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPESP1Q6UW49 350 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MICU2Q8IYU8 434 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 AADATQ8N5Z0 425 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 MBOAT4Q96T53 435 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PPW3 197 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LEFTY2O00292 366 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TGM5O43548 720 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINA1P01009 418 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM60Q495X7 471 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 FGD3Q5JSP0 725 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 USP45Q70EL2 814 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 LEMD2Q8NC56 503 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 BRD9Q9H8M2 597 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SPG21Q9NZD8 308 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 CD247P20963 164 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 S100A3P33764 101 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-201ENST00000325599 SMU1Q2TAY7 513 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms