RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 PTPRSQ13332 1948 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 H0Y626 953 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CCL16O15467 120 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 LDB2O43679 373 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ANGPTL1O95841 491 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 FTH1P02794 183 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CKMP06732 381 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PFKLP17858 780 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 GGT1P19440 569 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 DGKQP52824 942 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 LCP2Q13094 533 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 DESI1Q6ICB0 168 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 MED30Q96HR3 178 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ASB2Q96Q27 587 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SP140LQ9H930 580 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 A0A1B0GVM2 712 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM172BPA6NC97 362 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 K7ERQ8 282 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 DNAJB5O75953 348 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CTSAP10619 480 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CYP4B1P13584 511 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CASP3P42574 277 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 AGTR2P50052 363 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PHC1P78364 1004 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 LGALS12Q96DT0 336 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 RDH12Q96NR8 316 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 HBEGFQ99075 208 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 MROH6A6NGR9 719 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SNX2O60749 519 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 NDST3O95803 873 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 GSNP06396 782 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 C8AP07357 584 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SYN1P17600 705 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 KRT6CP48668 564 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CLCA4Q14CN2 919 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 LAPTM4AQ15012 233 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC58Q4VC31 144 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SPATC1Q76KD6 591 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SYVN1Q86TM6 617 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SUN5Q8TC36 379 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TP53INP1Q96A56 240 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF583Q96ND8 569 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TCF25Q9BQ70 676 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 MGME1Q9BQP7 344 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 DYRK3O43781 588 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 FGBP02675 491 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SERPINF2P08697 491 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CCR2P41597 374 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 MCFD2Q8NI22 146 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PSKH2Q96QS6 385 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRTM1-201ENST00000295057 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms