RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GAB3Q8WWW8 586 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PPCDCQ96CD2 204 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CRELD1Q96HD1 420 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 COG8Q96MW5 612 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HBEGFQ99075 208 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PDFQ9HBH1 243 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CLDN7O95471 211 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NTRK1P04629 796 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ITGAMP11215 1152 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MTHFD2P13995 350 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ELK4P28324 431 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A4P31645 630 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RYKP34925 604 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DGCR6Q14129 220 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 STARD3Q14849 445 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IFI44LQ53G44 452 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 USP43Q70EL4 1123 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TRPV1Q8NER1 839 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MCFD2Q8NI22 146 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ANK1P16157 1881 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS4O75173 837 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 BCKDHAP12694 445 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CYP4B1P13584 511 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ENGP17813 658 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PRMT2P55345 433 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NOGQ13253 232 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MEP1AQ16819 746 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GIN1Q9NXP7 522 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 U3KQV3 271 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IRGMA1A4Y4 181 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IQCF5A8MTL0 148 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SOD2P04179 222 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KCNC1P48547 511 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KCNAB2Q13303 367 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PON2Q15165 354 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SZRD1Q7Z422 152 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CCDC103Q8IW40 242 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TADA1Q96BN2 335 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SELENONQ9NZV5 590 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DPP7Q9UHL4 492 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MUSKO15146 869 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 UGDHO60701 494 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PRSS56P0CW18 603 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ITIH1P19827 911 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HNF1BP35680 557 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PIK3CBP42338 1070 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NFATC3Q12968 1075 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TP53BP2Q13625 1128 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KEAP1Q14145 624 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PHKG1Q16816 387 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.62□□□□□ -1.03
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