RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029444.12

Trim33-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim33, Length 8,875 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim33-201ENSMUST00000029444 Slc39a13Q8BZH0 361 aa20.48■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Tmprss4Q8VCA5 435 aa20.48■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Mul1Q8VCM5 352 aa20.48■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 AccslQ3UX83 580 aa20.48■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Tmem39aQ9CYC3 486 aa20.48■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Dgat2Q9DCV3 388 aa20.48■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Pgm2Q7TSV4 620 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Inpp5kQ8C5L6 468 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Pofut2Q8VHI3 429 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Jph3Q9ET77 744 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Olfr1508Q9R0K4 310 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Htatip2Q9Z2G9 242 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Tex46Q9CPU3 165 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Cyp2g1Q9WV19 494 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Tmem236A2ARJ3 344 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Npr3P70180 536 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Q8CD60 292 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Vmn1r219Q8R271 312 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Serinc3Q9QZI9 472 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Map3k14Q9WUL6 942 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Actl10A2AKE7 346 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 PrnpP04925 254 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Kctd19Q562E2 927 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Scara5Q8K299 491 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Stoml2Q99JB2 353 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ssna1Q9JJ94 119 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Prokr1Q9JKL1 393 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Aknad1E9Q8N6 675 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Cyp2a4P15392 494 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Man2a1P27046 1150 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Elk4P41158 430 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 TdgP56581 421 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Olfr1280Q8VGG8 305 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Slamf9Q9D780 285 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Mfsd2aQ9DA75 534 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Zfp949E9Q732 603 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Limk2O54785 638 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Gm16286Q9CQX6 220 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Acbd6Q9D061 282 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Rtl8cQ9D6I0 112 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Lin37Q9D8N6 246 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Slc7a8Q9QXW9 531 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Gm4985A2ALC6 410 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ltb4rO88855 351 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Wnt3aP27467 352 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Cypt2Q6P924 180 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Gprc5aQ8BHL4 356 aa20.47■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Diras2Q5PR73 199 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Galnt10Q6P9S7 603 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Fam129bQ8R1F1 749 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ttll11A4Q9F4 727 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Zfp990B1AVN5 605 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Tmem63bQ3TWI9 832 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ccser1Q8C0C4 895 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Fam221bQ8C627 487 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ralgps1A2AR50 585 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Cmklr1P97468 371 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Krt33aQ8K0Y2 404 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Nufip1Q9QXX8 484 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Nudt8Q9CR24 210 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 TfgQ9Z1A1 397 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Gstm1P10649 218 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Scarf2P59222 833 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 UradQ283N4 178 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Adam5Q3TTE0 751 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 OsgepQ8BWU5 335 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Olfr690Q8VH18 315 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Pcdhb18Q91Y02 792 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ephx2P34914 554 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ctbp2P56546 445 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 TmieQ8K467 153 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Hid1Q8R1F6 788 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ces2cQ91WG0 561 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Slc22a23Q3UHH2 689 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Prokr2Q8K458 381 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 Zfp810Q99K45 461 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 RTRAFQ9CQE8 244 aa20.46■□□□□ 0.87
Trim33-201ENSMUST00000029444 P01740 135 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Pcdha6Q91Y14 946 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Pcdha2Q91Y17 948 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Sall1Q9ER74 1322 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Prl4a1O35256 227 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Asgr1P34927 284 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 RoraP51448 523 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Adamts16Q69Z28 1222 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Rftn1Q6A0D4 554 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Smim5Q8BT42 78 aa20.45■□□□□ 0.86
Trim33-201ENSMUST00000029444 Ca12Q8CI85 354 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.4 ms