RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023154.2

Cldn1-201, Transcript of Claudin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn1, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ahcyl1Q80SW1 530 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Adamtsl4Q80T21 1036 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 StgQ8BM15 349 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 AgmoQ8BS35 447 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Arel1Q8CHG5 823 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ZwilchQ8R060 589 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vmn1r206Q8R277 312 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nxnl1Q8VC33 217 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr45Q8VGM1 311 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sfxn1Q99JR1 322 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 AdprmQ99KS6 340 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Itfg1Q99KW9 610 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Amdhd1Q9DBA8 426 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fbxl12Q9EPX5 326 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sae1Q9R1T2 350 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PtsQ9R1Z7 144 aa8.9□□□□□ -0.98
Cldn1-201ENSMUST00000023154 DmdP11531 3678 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fam209A2APA5 170 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1153A2AVC0 318 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm2956E9PVJ0 216 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ccdc149F6V035 524 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vmn2r61L7N2B8 865 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kcnk1O08581 336 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CtssO70370 340 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Matn4O89029 624 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P01675 107 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P01676 107 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P01677 107 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P01678 107 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cd8aP01731 247 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P06324 132 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 LynP25911 512 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 TfamP40630 243 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fgf13P70377 245 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tgm3Q08189 693 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prss57Q14B24 284 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Krt2Q3TTY5 707 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Axdnd1Q3UZ57 424 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc10a7Q5PT53 340 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cpa6Q5U901 438 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Adora2bQ60614 332 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ggt1Q60928 568 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Il17aQ62386 158 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fam149b1Q6NSV7 578 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ptx4Q6RUU0 478 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tas2r39Q7TQA5 319 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sgo2Q7TSY8 1164 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kctd2Q8CEZ0 266 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fam161aQ8QZV6 448 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 IlkapQ8R0F6 392 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Trim12aQ99PQ1 284 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MINDY3Q9CV28 444 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gid8Q9D7M1 228 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 B4galt6Q9WVK5 382 aa8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hcn4O70507 1186 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Serpina3kP07759 418 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 TecP24604 630 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ephx2P34914 554 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Grik2P39087 908 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Armc5Q5EBP3 926 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Bpifb1Q61114 474 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pde1aQ61481 565 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hsd3b5Q61694 373 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Il10raQ61727 575 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ikzf5Q8BU00 419 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem62Q8BXJ9 643 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Asrgl1Q8C0M9 326 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Acat2Q8CAY6 397 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ssh3Q8K330 649 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 DgkgQ91WG7 788 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Klhl35Q9CZ49 574 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 DlstQ9D2G2 454 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 HaghlQ9DB32 283 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rgs3Q9DC04 966 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Stk19Q9JHN8 254 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm29776A0A286YEC0 699 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Erich2E9Q1A6 463 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Bnc1O35914 961 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Phxr1P15973 60 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Epb42P49222 691 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pex11gQ6P6M5 241 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1037Q7TR84 321 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr855Q7TRF8 312 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Znf32Q80V23 272 aa8.89□□□□□ -0.99
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.6 ms