RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 AGPSO00116 658 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN1O95832 211 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PKLRP30613 574 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 RAB28P51157 221 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A15Q8IZD6 547 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01555Q8NAE3 123 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 DLG3Q92796 817 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 HDAC10Q969S8 669 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 MENTQ9BUN1 341 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 AMFRQ9UKV5 643 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL20Q9Y2M5 609 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ANKUB1A6NFN9 424 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ONECUT2O95948 504 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ITGAXP20702 1163 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 MAGP20916 626 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ALAS2P22557 587 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CCR7P32248 378 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 PEX26Q7Z412 305 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CUZD1Q86UP6 607 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 FKBP10Q96AY3 582 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 TTC1Q99614 292 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SLC5A6Q9Y289 635 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 F8W8V4 182 aa23.94■■□□□ 1.42
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PTPRF-216ENST00000617451 MMP11P24347 488 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 COL8A1P27658 744 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ARSFP54793 590 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CDH17Q12864 832 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 TTLL10Q6ZVT0 673 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 OVCH1Q7RTY7 1134 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 VRK3Q8IV63 474 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 DNAAF3Q8N9W5 541 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 NTNG1Q9Y2I2 539 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 PCM1Q15154 2024 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GX78 115 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 HEATR9A2RTY3 570 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 GPC4O75487 556 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ALBP02768 609 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CD9P21926 228 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 HSPA14Q0VDF9 509 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF787Q6DD87 383 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.93■■□□□ 1.42
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PTPRF-216ENST00000617451 ASZ1Q8WWH4 475 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A18Q96BI1 424 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf34Q96MH7 638 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 WDR54Q9H977 334 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL4Q9UKA2 621 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SUN1O94901 812 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 GAS8O95995 478 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 RPN2P04844 631 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA3P26006 1051 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 GLRBP48167 497 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ACVR1Q04771 509 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 GRB7Q14451 532 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF534Q76KX8 674 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 OR4L1Q8NH43 312 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF778Q96MU6 729 aa23.92■■□□□ 1.42
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A1Q9H2B4 701 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A20Q9NP91 592 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ENAMQ9NRM1 1142 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 LRBAP50851 2863 aa23.92■■□□□ 1.42
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PTPRF-216ENST00000617451 S1PR4O95977 384 aa23.91■■□□□ 1.42
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PTPRF-216ENST00000617451 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 NKG7Q16617 165 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 FCRL6Q6DN72 434 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 OR2L8Q8NGY9 312 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 IL17FQ96PD4 163 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SPSB2Q99619 263 aa23.91■■□□□ 1.42
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