RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.1-201ENST00000613894 SMARCB1Q12824 385 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 KCNC3Q14003 757 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 QPRTQ15274 297 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF79Q15937 498 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 DPH6Q7L8W6 267 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PLPP6Q8IY26 295 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF675Q8TD23 568 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM162AQ96A26 154 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC120Q96HB5 630 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 HYLS1Q96M11 299 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 FCRL5Q96RD9 977 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 GABARAPL3Q9BY60 117 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CDT1Q9H211 546 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 OR51E2Q9H255 320 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PPA2Q9H2U2 334 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PIF1Q9H611 641 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 WDR70Q9NW82 654 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 LACTBL1A8MY62 500 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PPP6CO00743 305 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 STX16O14662 325 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 KIAA0513O60268 411 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 DPM1O60762 260 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ERN1O75460 977 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CD1DP15813 335 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 HOXA9P31269 272 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 HMGCLP35914 325 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CBX5P45973 191 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 SUOXP51687 545 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 RBP5P82980 135 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CYP4F3Q08477 520 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 MAB21L1Q13394 359 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 DSC3Q14574 896 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 KCTD2Q14681 263 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 GPR19Q15760 415 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ATG9BQ674R7 924 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 LRRC66Q68CR7 880 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 FAHD1Q6P587 224 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CALHM3Q86XJ0 350 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 DNASE1L2Q92874 299 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PMEPA1Q969W9 287 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PTERQ96BW5 349 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PYURFQ96I23 114 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PPM1MQ96MI6 270 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 NPY6RQ99463 290 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 MMP28Q9H239 520 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 FZD8Q9H461 694 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 VNN3Q9NY84 501 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.09□□□□□ -0.63
CU633980.1-201ENST00000613894 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 AKR7A2O43488 359 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 KCNJ13O60928 360 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 CREG1O75629 220 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 HLA-DQB1P01920 261 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 DNTTP04053 509 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 TNNI3P19429 210 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 FDXRP22570 491 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 SOX11P35716 441 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 CASP2P42575 452 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 SOX9P48436 509 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 CPT1AP50416 773 aa11.08□□□□□ -0.64
CU633980.1-201ENST00000613894 ARHGDIAP52565 204 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms