RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA1P56199 1179 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CTBP1Q13363 440 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS3Q14952 304 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KYNUQ16719 465 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ARMC3Q5W041 872 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CNSTQ6PJW8 725 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PCGF5Q86SE9 256 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OR1L3Q8NH93 324 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CALML6Q8TD86 181 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CT55Q8WUE5 264 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 LPGAT1Q92604 370 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 IL17FQ96PD4 163 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OR2A14Q96R47 310 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CDYLQ9Y232 598 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TENM4Q6N022 2769 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 B8ZZF3 427 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MEN1O00255 615 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RASGRF2O14827 1237 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 CREG1O75629 220 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OR2B3O76000 313 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 USP1O94782 785 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf105O95561 183 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TPBGLP0DKB5 382 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 AGXTP21549 392 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PKLRP30613 574 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CCNFP41002 786 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 BDKRB1P46663 353 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 POLE2P56282 527 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 KCNAB2Q13303 367 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM135Q86UB9 458 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB2Q8N680 514 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 BIRC8Q96P09 236 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GPR87Q9BY21 358 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CHST8Q9H2A9 424 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ACTL8Q9H568 366 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FAM60AQ9NP50 221 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SNX7Q9UNH6 387 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 POLHQ9Y253 713 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NFS1Q9Y697 457 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SPTA1P02549 2419 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 C9J4A7 227 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MAP2K7O14733 419 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SLC28A2O43868 658 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
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