RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PSMD10O75832 226 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZFPL1O95159 310 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFA10O95299 355 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SNAP29O95721 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MBD3O95983 291 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 POMCP01189 267 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TRBC1P01850 177 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ITGA5P08648 1049 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CYP21A2P08686 494 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G4BP0C869 781 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UROSP10746 265 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 F3P13726 295 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ERCC2P18074 760 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 EPORP19235 508 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CCNOP22674 350 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 G0S2P27469 103 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TACR3P29371 465 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CD40LGP29965 261 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AVPR2P30518 371 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINB1P30740 379 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LCN1P31025 176 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PHBP35232 272 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PAFAH1B1P43034 410 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KHKP50053 298 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DGKEP52429 567 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAA2P54646 552 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PDE1AP54750 535 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PEX3P56589 373 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A3Q01959 620 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC63Q05C16 580 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MGAT5Q09328 741 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MAB21L1Q13394 359 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GCKRQ14397 625 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CEBPEQ15744 281 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NPTX1Q15818 432 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BAK1Q16611 211 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NTRK2Q16620 822 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STX1AQ16623 288 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MAN2A1Q16706 1144 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R3AQ16821 1122 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BEAN1Q3B7T3 259 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GTDC1Q4AE62 458 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 EPC2Q52LR7 807 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MPPE1Q53F39 396 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HIKESHIQ53FT3 197 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BROXQ5VW32 411 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MLIPQ5VWP3 458 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LIPNQ5VXI9 398 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PYHIN1Q6K0P9 492 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FSTL4Q6MZW2 842 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CDC73Q6P1J9 531 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 VITQ6UXI7 678 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC9AQ6UXN8 241 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STOX1Q6ZVD7 989 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TRILQ7L0X0 811 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD9Q7L273 389 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFAF7Q7L592 441 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PAGE2Q7Z2X7 111 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C1QL2Q7Z5L3 287 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 VTCN1Q7Z7D3 282 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SYVN1Q86TM6 617 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CUZD1Q86UP6 607 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF573Q86YE8 665 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MISPQ8IVT2 679 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BBS7Q8IWZ6 715 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KATNAL2Q8IYT4 538 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ENTHD1Q8IYW4 607 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF786Q8N393 782 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FRMD1Q8N878 549 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MLKLQ8NB16 471 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GLIS1Q8NBF1 620 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LEMD2Q8NC56 503 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf18Q8NEA5 215 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR2L3Q8NG85 312 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR8J1Q8NGP2 316 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NDNFQ8TB73 568 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC2A14Q8TDB8 520 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CHURC1Q8WUH1 139 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LPGAT1Q92604 370 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RSC1A1Q92681 617 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms