RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567365.2

RNF40-211, Transcript of ring finger protein 40, humanhuman

TSL 3

Gene RNF40, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40-211ENST00000567365 UGT2B7P16662 529 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 KIR2DS3Q14952 304 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FAM153CQ494X1 144 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SPESP1Q6UW49 350 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PPM1NQ8N819 430 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 OR9A1PQ8NGU1 263 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ANKRD7Q92527 254 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FOPNLQ96NB1 174 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 DDA1Q9BW61 102 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SLC12A9Q9BXP2 914 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 POPDC3Q9HBV1 291 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SPATA7Q9P0W8 599 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 IKZF3Q9UKT9 509 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 LHX6Q9UPM6 363 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 KLK4Q9Y5K2 254 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa12□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PCM1Q15154 2024 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 EFCAB7A8K855 629 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 C2orf74A8MZ97 194 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SLC16A5O15375 505 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 KDM1AO60341 852 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SLC16A8O95907 504 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 CATP04040 527 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ABHD2P08910 425 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 JMJD7P0C870 316 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ST6GAL1P15907 406 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SLC5A2P31639 672 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 RGS4P49798 205 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SEPHS1P49903 392 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 IL2P60568 153 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SH3BP2P78314 561 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 POU4F1Q01851 419 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PRKAA1Q13131 559 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ZNF460Q14592 562 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SLMAPQ14BN4 828 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 GRTP1Q5TC63 336 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SBSNQ6UWP8 590 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 DTX1Q86Y01 620 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FGF11Q92914 225 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 USP7Q93009 1102 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 LINGO1Q96FE5 620 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 TAAR9Q96RI9 348 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 CYTH2Q99418 400 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PKP4Q99569 1192 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ZMYND15Q9H091 742 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 APMAPQ9HDC9 416 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 THSD1Q9NS62 852 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PDE10AQ9Y233 779 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SPTBP11277 2137 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 MGAQ8IWI9 3026 aa11.99□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 GSAPA4D1B5 854 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 E7ENX8 843 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 H3BMH7 237 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 AGRPO00253 132 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PRAMEF10O60809 474 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 RASSF9O75901 435 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FKBP9O95302 570 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ACSL3O95573 720 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 C8GP07360 202 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FGF5P12034 268 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PVRP15151 417 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FOLR1P15328 257 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 GABRA4P48169 554 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 RAB15P59190 212 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 HSD11B2P80365 405 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 TAP2Q03519 686 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 SP140Q13342 867 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ZIC1Q15915 447 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PHKG1Q16816 387 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 TEX35Q5T0J7 233 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ANKS6Q68DC2 871 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.98□□□□□ -0.49
RNF40-211ENST00000567365 TTC23LQ6PF05 361 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166.6 ms