RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565987.5

NUBP2-208, Transcript of nucleotide binding protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene NUBP2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBP2-208	ENST00000565987	CHAF1B	Q13112	559 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	GRB7	Q14451	532 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	KIR2DS3	Q14952	304 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	KYNU	Q16719	465 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TTC27	Q6P3X3	843 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SEC14L1	Q92503	715 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	IL17F	Q96PD4	163 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MENT	Q9BUN1	341 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	KIFC1	Q9BW19	673 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	NLN	Q9BYT8	704 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	VPS4A	Q9UN37	437 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SNX7	Q9UNH6	387 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ARGFX	A6NJG6	315 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NRDC	O43847	1150 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KDM1A	O60341	852 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	AVIL	O75366	819 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NDUFS3	O75489	264 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SLCO2B1	O94956	709 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	VAPB	O95292	243 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RAB28	P51157	221 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CDK16	Q00536	496 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	GPS1	Q13098	491 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KCNJ11	Q14654	390 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TMED2	Q15363	201 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	GPR135	Q8IZ08	494 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MPP5	Q8N3R9	675 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	THAP4	Q8WY91	577 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MS4A14	Q96JA4	679 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PHF12	Q96QT6	1004 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TCFL5	Q9UL49	500 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SOX13	Q9UN79	622 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	AKAP9	Q99996	3911 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ESPL1	Q14674	2120 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		15.2	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SEMA7A	O75326	666 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	OR2B3	O76000	313 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KRT14	P02533	472 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PDGFA	P04085	211 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RPN2	P04844	631 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CBSL	P0DN79	551 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MAG	P20916	626 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	GNLY	P22749	145 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02	5e-7	■■■■■ 31.5
NUBP2-208	ENST00000565987	TNFRSF8	P28908	595 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CBS	P35520	551 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PTGIR	P43119	386 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NCF4	Q15080	339 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	C1orf189	Q5VU69	101 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	LRRC6	Q86X45	466 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PANX3	Q96QZ0	392 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NFS1	Q9Y697	457 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KRT87P	A6NCN2	255 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM63A	O94886	807 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	HBQ1	P09105	142 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CD9	P21926	228 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FMO4	P31512	558 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	DCT	P40126	519 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MAGEA6	P43360	314 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	BDKRB1	P46663	353 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TEX19	Q8NA77	164 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	LPGAT1	Q92604	370 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM136A	Q96C01	138 aa		15.18	■□□□□ 0.02

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