RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXC9	P31274	260 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A6	P31641	620 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	IER3	P46695	156 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ1	P48048	391 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ARSF	P54793	590 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH13	P55290	713 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PTEN	P60484	403 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MST1R	Q04912	1400 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DMTN	Q08495	405 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPB3	Q12988	150 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE7A	Q13946	482 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GIT2	Q14161	759 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGR1	Q14914	329 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NR1D2	Q14995	579 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DLG2	Q15700	870 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	STXBP2	Q15833	593 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TCTN1	Q2MV58	587 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF19	Q2TAC6	998 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EPC2	Q52LR7	807 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL26	Q53HC5	615 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD11	Q693B1	232 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIL	Q7L0X0	811 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MDGA2	Q7Z553	956 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF573	Q86YE8	665 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL14	Q8N4G2	192 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM199	Q8N511	208 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM47B	Q8NA70	645 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CASP10	Q92851	521 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAPC3	Q92966	411 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MED30	Q96HR3	178 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TPD52L3	Q96J77	140 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF560	Q96MR9	790 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MUS81	Q96NY9	551 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	BBS4	Q96RK4	519 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MYADM	Q96S97	322 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PLIN2	Q99541	437 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC77	Q9BR77	488 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CARD6	Q9BX69	1037 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB17	Q9H0T7	212 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FANCE	Q9HB96	536 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RAI14	Q9P0K7	980 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NLK	Q9UBE8	527 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	POLL	Q9UGP5	575 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP45	Q9UL16	551 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	2.72	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EMSY	Q7Z589	1322 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0U1RQS6	177 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM157A	C9JC47	383 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM77	I1YAP6	450 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP2K7	O14733	419 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MEIS2	O14770	477 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP2A1	O14983	1001 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ST8SIA3	O43173	380 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNG3	O60359	315 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CRCP	O75575	148 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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