RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ADAMTS17-205ENST00000558960 MENTQ9BUN1 341 aa20.31■□□□□ 0.84
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ADAMTS17-205ENST00000558960 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.31■□□□□ 0.84
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ADAMTS17-205ENST00000558960 HIST1H2ADP20671 130 aa20.28■□□□□ 0.84
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ADAMTS17-205ENST00000558960 STK17BO94768 372 aa20.27■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 ITPKBP27987 946 aa20.27■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 TLE3Q04726 772 aa20.27■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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ADAMTS17-205ENST00000558960 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.27■□□□□ 0.84
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ADAMTS17-205ENST00000558960 ESX1Q8N693 406 aa20.27■□□□□ 0.84
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