RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	EURL	Q9NYK6	297 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CEP104	O60308	925 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NDUFS3	O75489	264 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	C1orf105	O95561	183 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	S1PR4	O95977	384 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CXCR5	P32302	372 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CDK16	Q00536	496 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TMED2	Q15363	201 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936		A6NL46	340 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	KPNA5	O15131	536 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	VAPB	O95292	243 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CD63	P08962	238 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FMO4	P31512	558 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	OTX2	P32243	289 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RRAD	P55042	308 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CCZ1B	P86790	482 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NDC1	Q9BTX1	674 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FOLR3	P41439	243 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GRIA3	P42263	894 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	BDKRB1	P46663	353 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TERF1	P54274	439 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ARSF	P54793	590 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FOXL2	P58012	376 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GBX1	Q14549	363 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PTER	Q96BW5	349 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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