RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529048.5

TSTA3-209, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-209ENST00000529048 MROH9Q5TGP6 573 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 ANKS6Q68DC2 871 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 CLEC14AQ86T13 490 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 PLXDC1Q8IUK5 500 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 DENND6AQ8IWF6 608 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 LMNTD2Q8IXW0 634 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 CFAP61Q8NHU2 1237 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 CALML6Q8TD86 181 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 KCNE4Q8WWG9 221 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 PPM1MQ96MI6 270 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 DPYSL5Q9BPU6 564 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 FAM107BQ9H098 131 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 P2RY12Q9H244 342 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 VPS11Q9H270 941 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 APMAPQ9HDC9 416 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 PDP2Q9P2J9 529 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 PLAGL1Q9UM63 463 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 PSAT1Q9Y617 370 aa13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 SLC5A10A0PJK1 596 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 KLHL33A6NCF5 533 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 GOLGA8RI6L899 631 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 QSOX1O00391 747 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 KLK10O43240 276 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 GLRA3O75311 464 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 NIPSNAP2O75323 286 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 TAC1P20366 129 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 ETV4P43268 484 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 SH3BP2P78314 561 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 ABRQ12979 859 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 CTBP1Q13363 440 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 NEPROQ6NW34 567 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 STRA8Q7Z7C7 330 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 GALNT7Q86SF2 657 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 PDZD3Q86UT5 571 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 TRIM42Q8IWZ5 723 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 OR52E1Q8NGJ3 308 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 TMEM159Q96B96 161 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 ELMO2Q96JJ3 720 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 RHOJQ9H4E5 214 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 EPB41L1Q9H4G0 881 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 GALPQ9UBC7 116 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 ASF1AQ9Y294 204 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa13.53□□□□□ -0.24
TSTA3-209ENST00000529048 A0A087WV48 116 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 OR5K3A6NET4 321 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 GSTA1P08263 222 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 ABCG1P45844 678 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 MPP1Q00013 466 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 FOXM1Q08050 763 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 RPA4Q13156 261 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 KCNAB1Q14722 419 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 LCA5Q86VQ0 697 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 BMPERQ8N8U9 685 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 LCN9Q8WX39 176 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 LPGAT1Q92604 370 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 GPR22Q99680 433 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 MAP3K3Q99759 626 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TSTA3-209ENST00000529048 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms