RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527273.5

RPS3-208, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-208ENST00000527273 MRGPREQ86SM8 312 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CCDC89Q8N998 374 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 Q8NA96 180 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 ASZ1Q8WWH4 475 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 MENTQ9BUN1 341 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CARD6Q9BX69 1037 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PAK5Q9P286 719 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.14□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 GPC4O75487 556 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 APOA4P06727 396 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CD9P21926 228 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 ALAS2P22557 587 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 AOAHP28039 575 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 GRIA3P42263 894 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 GRB7Q14451 532 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SSPNQ14714 243 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 NDC1Q9BTX1 674 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SLC22A11Q9NSA0 550 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 EURLQ9NYK6 297 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.13□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 KRT87PA6NCN2 255 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PEX12O00623 359 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 KRT86O43790 486 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 AGFG2O95081 481 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 RPN2P04844 631 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 UMODP07911 640 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 MCM3P25205 808 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 NMBRP28336 390 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CDC25BP30305 580 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 RPS6KA1Q15418 735 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PCID2Q5JVF3 399 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 DCAF10Q5QP82 559 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 FHL5Q5TD97 284 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 FCRL6Q6DN72 434 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 UNC5DQ6UXZ4 953 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 GALNT16Q8N428 558 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PTERQ96BW5 349 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 C19orf60Q96EN9 201 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 IP6K3Q96PC2 410 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SLC39A10Q9ULF5 831 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 NFS1Q9Y697 457 aa11.12□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 RASGRF2O14827 1237 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SEMA7AO75326 666 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 ALOX12BO75342 701 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 SLCO2B1O94956 709 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 S1PR4O95977 384 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 ITGAXP20702 1163 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 PSMB5P28074 263 aa11.11□□□□□ -0.63
RPS3-208ENST00000527273 BDKRB1P46663 353 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms