RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516908.1

RNU6-352P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 352, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-352P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-352P-201ENST00000516908 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 Q6ZRM9 215 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 Q6ZSR6 202 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 DPPA4Q7L190 304 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF567Q8N184 647 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TTC30BQ8N4P2 665 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 EID2Q8N6I1 236 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 KCTD6Q8NC69 237 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PDPRQ8NCN5 879 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ACTL9Q8TC94 416 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 Q8TCH9 128 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 EXOC4Q96A65 974 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TADA1Q96BN2 335 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CENPTQ96BT3 561 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 MIEF2Q96C03 454 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 COQ10AQ96MF6 247 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 AGAP3Q96P47 875 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PSKH2Q96QS6 385 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 IL12RB2Q99665 862 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ATRXP46100 2492 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CACNA1BQ00975 2339 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 SDK2Q58EX2 2172 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TENM4Q6N022 2769 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 KRT87PA6NCN2 255 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 LRRC72A6NJI9 287 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CAPN14A8MX76 684 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 M0QYG6 137 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TLR4O00206 839 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 APOL1O14791 398 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 MATN3O15232 486 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 INPP4BO15327 924 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 MTX2O75431 263 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PMPCBO75439 489 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PIAS2O75928 621 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLDN7O95471 211 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 METTL18O95568 372 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 GRPP07492 148 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ADRB1P08588 477 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 FDXRP22570 491 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 GCSHP23434 173 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CTNNA2P26232 953 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PSMB4P28070 264 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 OXTRP30559 389 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 CXCR5P32302 372 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 GRIA1P42261 906 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ACADVLP49748 655 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 STC1P52823 247 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 TERF1P54274 439 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 AIF1P55008 147 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 UCP3P55916 312 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 NHLH2Q02577 135 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZBTB16Q05516 673 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 AP1B1Q10567 949 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PMS2P11Q13670 270 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF235Q14590 738 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 ICAM4Q14773 271 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 UGP2Q16851 508 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 BOLA3Q53S33 107 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-352P-201ENST00000516908 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms