RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHF11Q9UIL8 331 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 GDAQ9Y2T3 454 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 AUP1Q9Y679 476 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 SORL1Q92673 2214 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYO16Q9Y6X6 1858 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 G3V2L1 256 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 VILLO15195 856 aa-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 GCNT3O95395 438 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 QDPRP09417 244 aa-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 MCL1Q07820 350 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDH18Q13634 790 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF74Q16587 644 aa-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF544Q6NX49 715 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 KSR2Q6VAB6 950 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 CNTROBQ8N137 903 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARRDC1Q8N5I2 433 aa-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 AFG1LQ8WV93 481 aa-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 GTSF1Q8WW33 167 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL22RA2Q969J5 263 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 TBC1D20Q96BZ9 403 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC22A12Q96S37 553 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 NYXQ9GZU5 481 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 GORASP2Q9H8Y8 452 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa-0.19□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NHLRC3Q5JS37 347 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM209BQ5JX69 171 aa-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 OR6Y1Q8NGX8 325 aa-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-162P-201ENST00000516228 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 JAKMIP2Q96AA8 810 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTC17Q96AE7 1141 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAF2Q96CS3 445 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 HDAC11Q96DB2 347 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIFC3Q9BVG8 833 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 THAP2Q9H0W7 228 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF446Q9NWS9 450 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 PEMTQ9UBM1 199 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF229Q9UJW7 825 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 OSGIN1Q9UJX0 560 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 MOKQ9UQ07 419 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 SELENOKQ9Y6D0 94 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 A8MX80 341 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 USP17L23D6RBM5 183 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 NPIPB9F8W1W9 429 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-162P-201ENST00000516228 DLGAP1O14490 977 aa-0.21□□□□□ -2.44
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