RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513272.5

TMA16-209, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMA16, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-209ENST00000513272 SLC22A18Q96BI1 424 aa18.28■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.28■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 SOX13Q9UN79 622 aa18.28■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 RASGRF2O14827 1237 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 TMEM63AO94886 807 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 KRT14P02533 472 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 FMO4P31512 558 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 FOXK1P85037 733 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 KCNJ11Q14654 390 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 CTSL3PQ5NE16 218 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 MLIPQ5VWP3 458 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 TTC27Q6P3X3 843 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 CASC4Q6P4E1 433 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 TLDC1Q6P9B6 456 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 MS4A14Q96JA4 679 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 BIRC8Q96P09 236 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 EURLQ9NYK6 297 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 NFS1Q9Y697 457 aa18.27■□□□□ 0.52
TMA16-209ENST00000513272 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PFDN6O15212 129 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 S1PR4O95977 384 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 BDKRB1P46663 353 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PGDP52209 483 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 DCDP81605 110 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 ANKRD22Q5VYY1 191 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 CNSTQ6PJW8 725 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 ZBTB2Q8N680 514 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PROKR1Q8TCW9 393 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 LPGAT1Q92604 370 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 RAD51AP1Q96B01 352 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 FAM136AQ96C01 138 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 GBP5Q96PP8 586 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 TCF12Q99081 682 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 NDC1Q9BTX1 674 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 DHRS4Q9BTZ2 278 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 SRPK3Q9UPE1 567 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 JRKLQ9Y4A0 524 aa18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 KRT87PA6NCN2 255 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 NIPSNAP2O75323 286 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 C1orf105O95561 183 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PAMP19021 973 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 OTX2P32243 289 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 GRIA3P42263 894 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 MAGEA6P43360 314 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 ATP1A4Q13733 1029 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 SLC9A5Q14940 896 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 CCSMST1Q4G0I0 132 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 RAB42Q8N4Z0 105 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PBKQ96KB5 322 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 FOPNLQ96NB1 174 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 SAMD15Q9P1V8 674 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 SEC16AO15027 2179 aa18.25■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 H3BMM5 538 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 ZNF185O15231 689 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 ESR1P03372 595 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 CHRM3P20309 590 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 ALAS2P22557 587 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 MLLT10P55197 1068 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 NEPROQ6NW34 567 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 FIGLAQ6QHK4 219 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 MED25Q71SY5 747 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 RAB43Q86YS6 212 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PLAAQ9Y263 795 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 NBASA2RRP1 2371 aa18.24■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 A6NL46 340 aa18.23■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.23■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 OGNP20774 298 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 COILP38432 576 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 CCNFP41002 786 aa18.23■□□□□ 0.51
TMA16-209ENST00000513272 FOLR3P41439 243 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms