RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CYB5D1Q6P9G0 228 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CD200R1Q8TD46 325 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RUNDC3BQ96NL0 473 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR21Q99679 349 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 LHX9Q9NQ69 397 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KPNA5O15131 536 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PFDN6O15212 129 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD51CO43502 376 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 MATN4O95460 622 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CD9P21926 228 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRB3P28472 473 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5DP30049 168 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PGGT1BP53609 377 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS18P62269 152 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TBR1Q16650 682 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 HIF1AQ16665 826 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 LCN10Q6JVE6 187 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 GSDMBQ8TAX9 411 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CERS2Q96G23 380 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FANCEQ9HB96 536 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX24Q9Y343 169 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC16AO15027 2179 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BMH7 237 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FURINP09958 794 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM87AP0C7U9 286 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CASQ1P31415 396 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 DNASE1L3Q13609 305 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DS3Q14952 304 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM69BQ5VUD6 431 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 EXD3Q8N9H8 876 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA4Q8NEY3 305 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CALML6Q8TD86 181 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNJ9Q92806 393 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 DPH5Q9H2P9 285 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 LATS2Q9NRM7 1088 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPV9 198 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 MSL3P1P0C860 447 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RORAP35398 523 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 STEAP4Q687X5 459 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf46Q6P387 395 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 LMNTD2Q8IXW0 634 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PDIK1LQ8N165 341 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD51AP1Q96B01 352 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FCRL4Q96PJ5 515 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF14Q9UBS8 474 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MED13Q9UHV7 2174 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM1AO60341 852 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC4O95801 387 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB2P05107 769 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2A7P20853 494 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN2DP55273 166 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 FCRL6Q6DN72 434 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM198BQ6UWH4 519 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8K5Q8NH50 307 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PCMTD2Q9NV79 361 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 GRHL1Q9NZI5 618 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO1CO00159 1063 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 KATNA1O75449 491 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MT-ND3P03897 115 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ERGP11308 486 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms