RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RNF224P0DH78 156 aa12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 IVDP26440 423 aa12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 OTX2P32243 289 aa12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GRIA1P42261 906 aa12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GABRA4P48169 554 aa12.19□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 CDYLQ9Y232 598 aa12.19□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.18□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 AP2A2O94973 939 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PSMA3P25788 255 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SHMT2P34897 504 aa12.18□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 SEMA3AQ14563 771 aa12.18□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 TBC1D21Q8IYX1 336 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 OR13J1Q8NGT2 312 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 HDAC10Q969S8 669 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 LRRC45Q96CN5 670 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RAB17Q9H0T7 212 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 DPH5Q9H2P9 285 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PAK5Q9P286 719 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SNX24Q9Y343 169 aa12.18□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa12.18□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 ISM1B1AKI9 464 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 C9J4A7 227 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MAP3K7O43318 606 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SEMA7AO75326 666 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GOT2P00505 430 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 FTH1P02794 183 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ITIH4Q14624 930 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 KYNUQ16719 465 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SYTL3Q4VX76 610 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A19Q695T7 634 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MED25Q71SY5 747 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MRGPREQ86SM8 312 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GPR135Q8IZ08 494 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 DNAAF3Q8N9W5 541 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GALNT11Q8NCW6 608 aa12.17□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 C19orf60Q96EN9 201 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TCTN2Q96GX1 697 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GBP5Q96PP8 586 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ETNK1Q9HBU6 452 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GPR83Q9NYM4 423 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GRHL1Q9NZI5 618 aa12.17□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
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PRAME-212ENST00000485532 TEX15Q9BXT5 2789 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD12Q6UB98 2062 aa12.17□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 A0A0J9YY10 115 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TCP11X1B4DZS4 312 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 TP73O15350 636 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PSMD3O43242 534 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 AGFG2O95081 481 aa12.16□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 HBQ1P09105 142 aa12.16□□□□□ -0.46
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