RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 ARHGEF33A8MVX0 844 aa13.6□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 K7ENP7 123 aa13.6□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 KIAA0754O94854 1291 aa13.6□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 TUBB2AQ13885 445 aa13.6□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 MAP7Q14244 749 aa13.6□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 CPNE9Q8IYJ1 553 aa13.6□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.6□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 KLHL42Q9P2K6 505 aa13.6□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 ESYT3A0FGR9 886 aa13.59□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 ISM1B1AKI9 464 aa13.59□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 LIFP15018 202 aa13.59□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 SEC14L1Q92503 715 aa13.59□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 INPP5DQ92835 1189 aa13.59□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 LRRC1Q9BTT6 524 aa13.59□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 SAYSD1Q9NPB0 183 aa13.59□□□□□ -0.23
SRRT-210ENST00000477529 ZFATQ9P243 1243 aa13.59□□□□□ -0.23
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SRRT-210ENST00000477529 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 HCRTR1O43613 425 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 TUBB4AP04350 444 aa13.58□□□□□ -0.24
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SRRT-210ENST00000477529 MCM3P25205 808 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 PSMB5P28074 263 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 SSTR1P30872 391 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 CBSP35520 551 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 STAT5AP42229 794 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 GABRA4P48169 554 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 ZIC1Q15915 447 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 DEFB110Q30KQ9 67 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 TTC23LQ6PF05 361 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 MAGEC3Q8TD91 643 aa13.58□□□□□ -0.24
SRRT-210ENST00000477529 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.58□□□□□ -0.24
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