RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467081.1

CCNL1-209, Transcript of cyclin L1, human

TSL 3

Gene CCNL1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-209	ENST00000467081	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081		A0A0J9YWU9	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081		H7C423	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SQLE	Q14534	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	DYRK2	Q92630	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	8e-14	■□□□□ 8.9
CCNL1-209	ENST00000467081	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	CRLF1	O75462	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	DFFB	O76075	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	TOMM70	O94826	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	PTPN3	P26045	913 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	NNMT	P40261	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	MNDA	P41218	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	HERV-K104	P61576	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	PTER	Q96BW5	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	PGM3	O95394	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	JAK1	P23458	1154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	LPAL2	Q16609	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	UGP2	Q16851	508 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	VGLL1	Q99990	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	MIS12	Q9H081	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081		Q9N2K0	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-209	ENST00000467081	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	ZNF195	O14628	629 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	MOCS3	O95396	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	ADRB2	P07550	413 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	RASA2	Q15283	850 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNL1-209	ENST00000467081	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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