RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 OR8D1Q8WZ84 308 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 VPS33AQ96AX1 596 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AP2M1Q96CW1 435 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD9Q96Q07 612 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 OR4K3Q96R72 315 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PKP2Q99959 881 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GDF15Q99988 308 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf50Q9BV19 199 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 APOL5Q9BWW9 433 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SGPP1Q9BX95 441 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MUC13Q9H3R2 512 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CLMPQ9H6B4 373 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PIDD1Q9HB75 910 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SERHLQ9NQF3 203 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ARL15Q9NXU5 204 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 WWOXQ9NZC7 414 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GMEB1Q9Y692 573 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ANHXE9PGG2 379 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 H0YIV9 168 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PLK4O00444 970 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DLGAP1O14490 977 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CFLARO15519 480 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJA2O60884 412 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SCN2BO60939 215 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ATG13O75143 517 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KATNA1O75449 491 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL18O94889 574 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KAT7O95251 611 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PDYNP01213 254 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ERGP11308 486 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BCKDHAP12694 445 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 JUPP14923 745 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PCSK2P16519 638 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HRH2P25021 359 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HTR1EP28566 365 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 IMPA1P29218 277 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PDHA2P29803 388 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HMOX2P30519 316 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AKT1P31749 480 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK9P45984 424 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ERFP50548 548 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NME5P56597 212 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN8P56748 225 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ST8SIA6P61647 398 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CNTN1Q12860 1018 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BNIP2Q12982 314 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRKG2Q13237 762 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ADAM15Q13444 863 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PWP1Q13610 501 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SELPLGQ14242 412 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GRM2Q14416 872 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NUMA1Q14980 2115 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NR6A1Q15406 480 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC6Q16204 474 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KIF19Q2TAC6 998 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AP5B1Q2VPB7 878 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF284Q2VY69 593 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RABL3Q5HYI8 236 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LCE2CQ5TA81 110 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AGBL4Q5VU57 503 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 IL23RQ5VWK5 629 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LPCAT4Q643R3 524 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NANOGP8Q6NSW7 305 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LAYNQ6UX15 382 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DET1Q7L5Y6 550 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms