RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458938.2

U3.44-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 192 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.44-201ENST00000458938 KLHL26Q53HC5 615 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ZNF805Q5CZA5 627 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TMEM201Q5SNT2 666 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ATG16L1Q676U5 607 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 GALNT18Q6P9A2 607 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 AAGABQ6PD74 315 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 BORAQ6PGQ7 559 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC2A7Q6PXP3 512 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RANBP10Q6VN20 620 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SYT10Q6XYQ8 523 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ATG14Q6ZNE5 492 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 USP30Q70CQ3 517 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PID1Q7Z2X4 250 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PRUNE1Q86TP1 453 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 LONP2Q86WA8 852 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 LSMEM2Q8N112 164 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 KDM8Q8N371 416 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ATPAF2Q8N5M1 289 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ENKURQ8TC29 256 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HMGB4Q8WW32 186 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PIH1D2Q8WWB5 315 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 LZICQ8WZA0 190 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RTP4Q96DX8 246 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PHF21BQ96EK2 531 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CEP19Q96LK0 163 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 FCRL5Q96RD9 977 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TRIB3Q96RU7 358 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 VAT1Q99536 393 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SEMA3CQ99985 751 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 MGME1Q9BQP7 344 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HDAC8Q9BY41 377 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 EXO5Q9H790 373 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 UCK1Q9HA47 277 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 EBF2Q9HAK2 575 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SP110Q9HB58 689 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 IL21RQ9HBE5 538 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 GLOD4Q9HC38 313 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NT5MQ9NPB1 228 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ACSS2Q9NR19 701 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 WWOXQ9NZC7 414 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 COPG2Q9UBF2 871 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 FETUBQ9UGM5 382 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 APPL1Q9UKG1 709 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CROTQ9UKG9 612 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 BAG5Q9UL15 447 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RNF112Q9ULX5 631 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms