RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 SNF8Q96H20 258 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 KLHL25Q9H0H3 589 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC68Q9H2F9 335 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CROTQ9UKG9 612 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 PADI1Q9ULC6 663 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 NFS1Q9Y697 457 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 BSNQ9UPA5 3926 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC16AO15027 2179 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0J9YY10 115 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 ISM1B1AKI9 464 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM150CB9EJG8 249 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 MATN4O95460 622 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf105O95561 183 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 NTRK1P04629 796 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CASQ1P31415 396 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 DLSTP36957 453 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CCNFP41002 786 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 BDKRB1P46663 353 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CLCN7P51798 805 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGA8P53708 1063 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 ETF1P62495 437 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 MPP1Q00013 466 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLL9Q3SXZ7 439 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF549Q6P9A3 640 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGEC3Q8TD91 643 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 STARD8Q92502 1023 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNJ9Q92806 393 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 TCTN2Q96GX1 697 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 LRFN5Q96NI6 719 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 IL17FQ96PD4 163 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 KRT12Q99456 494 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 LHX9Q9NQ69 397 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 STARD5Q9NSY2 213 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 KLHL42Q9P2K6 505 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 GALPQ9UBC7 116 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CIDEBQ9UHD4 219 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC39A10Q9ULF5 831 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 COMMD10Q9Y6G5 202 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 C21orf140B9A014 251 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVK-10P10266 1014 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP2A7P20853 494 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 F8A1P23610 371 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGA1P56199 1179 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ARL4CP56559 192 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MC1RQ01726 317 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 DNASE1L3Q13609 305 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ZIC1Q15915 447 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 HIF1AQ16665 826 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 KLHL38Q2WGJ6 581 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ACSBG2Q5FVE4 666 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SYT10Q6XYQ8 523 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ATG14Q6ZNE5 492 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 NEK10Q6ZWH5 1172 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB42Q8N4Z0 105 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 OR1L3Q8NH93 324 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 GIMAP7Q8NHV1 300 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CT55Q8WUE5 264 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC39Q96DD0 335 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PWWP2AQ96N64 755 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM31Q9BZY9 425 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM60AQ9NP50 221 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SERTAD3Q9UJW9 196 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 KCND3Q9UK17 655 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 MED16Q9Y2X0 877 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 EFCAB8A8MWE9 144 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 NDC80O14777 642 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TP73O15350 636 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 NKX2-8O15522 239 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SUV39H1O43463 412 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 HAUS5O94927 633 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TCN2P20062 427 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 ELK3P41970 407 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 RPL21P46778 160 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC20Q12834 499 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 GPS2Q13227 327 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TBR1Q16650 682 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CCSMST1Q4G0I0 132 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 TAX1BP1Q86VP1 789 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC38A9Q8NBW4 561 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms