RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SNF8Q96H20 258 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 RANBP9Q96S59 729 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 RUFY1Q96T51 708 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TTC1Q99614 292 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MFRPQ9BY79 579 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 IL22Q9GZX6 179 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 WWP1Q9H0M0 922 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 VPS37BQ9H9H4 285 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SYBUQ9NX95 663 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MGAT4DA6NG13 374 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AP3B1O00203 1094 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PEX12O00623 359 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AVILO75366 819 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CLDN1O95832 211 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CYP2A7P20853 494 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CDH3P22223 829 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 FOXN2P32314 431 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NPY2RP49146 381 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PRLHRP49683 370 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PPP1CAP62136 330 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CALCOCO2Q13137 446 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 KCNJ11Q14654 390 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 BRD3Q15059 726 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NR6A1Q15406 480 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TRADDQ15628 312 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 KYNUQ16719 465 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SYTL3Q4VX76 610 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CES3Q6UWW8 571 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CLDN19Q8N6F1 224 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 Q8NA96 180 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GPR150Q8NGU9 434 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 OR2L2Q8NH16 312 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 OR4L1Q8NH43 312 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 IFT81Q8WYA0 676 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 C12orf66Q96MD2 445 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NUDT9Q9BW91 350 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SERTAD3Q9UJW9 196 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MED13Q9UHV7 2174 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 A6NL46 340 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AGAP14A8MT82 685 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 OR1I1O60431 355 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NMBRP28336 390 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF8P28908 595 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NSG1P42857 185 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PREPP48147 710 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ITGA8P53708 1063 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ITGA1P56199 1179 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 VSNL1P62760 191 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CDK16Q00536 496 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NCF4Q15080 339 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GPR19Q15760 415 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 METRNLQ641Q3 311 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZNF534Q76KX8 674 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GPR135Q8IZ08 494 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 HM13Q8TCT9 377 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ELMO1Q92556 727 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CCM2Q9BSQ5 444 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 LUZP4Q9P127 313 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms