RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 JRKO75564 520 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 MAGP20916 626 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 NSG1P42857 185 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CACNG1Q06432 222 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 Q0VFX4 171 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 MFAP5Q13361 173 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 BRD3Q15059 726 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 BCORP1Q8N888 145 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS50Q96JG6 964 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 QSOX1O00391 747 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDH17O14917 1159 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 DSCR3O14972 297 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KDM1AO60341 852 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KLHL18O94889 574 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 FTH1P02794 183 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 MARCKSL1P49006 195 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM14Q14142 442 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SPARCL1Q14515 664 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 RBBP7Q16576 425 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ACTL9Q8TC94 416 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ELMO1Q92556 727 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATA13Q96N96 652 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CUTCQ9NTM9 273 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CTSFQ9UBX1 484 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PDZD2O15018 2839 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TPM3P06753 285 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PKLRP30613 574 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 RAB28P51157 221 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ITIH4Q14624 930 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 GRM7Q14831 915 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 STYXQ8WUJ0 223 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 MENTQ9BUN1 341 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 SYCE3A1L190 88 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNN4O15554 427 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 HPP00738 406 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 RBP3P10745 1247 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TPH1P17752 444 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CD9P21926 228 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 MCM3P25205 808 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PSMA3P25788 255 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 PTGER4P35408 488 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 GRIA3P42263 894 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 OR1D4P47884 311 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TDGF1P3P51864 188 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNK10P57789 538 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 COPS2P61201 443 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 TCTE1Q5JU00 501 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC181Q5TID7 509 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTBP11-201ENST00000436287 KCTD11Q693B1 232 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms