RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 FOPNLQ96NB1 174 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ALG2Q9H553 416 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 DYRK4Q9NR20 520 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB26Q9ULW5 256 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC28Q96AY4 2481 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2AG2A6NM03 316 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 GPIP06744 558 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 JUPP14923 745 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 IL9P15248 144 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 HTR1EP28566 365 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CTSCP53634 463 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 NEK5Q6P3R8 708 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 OR8J3Q8NGG0 315 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CMTM7Q96FZ5 175 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ELOVL6Q9H5J4 265 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CDH7Q9ULB5 785 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SNX13Q9Y5W8 968 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SOD1P00441 154 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6V1B2P21281 511 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 GSK3BP49841 420 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 PFN3P60673 137 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 MED21Q13503 144 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA2013Q8IYS2 634 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SLCO4A1Q96BD0 722 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 DPY30Q9C005 99 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 S1PR5Q9H228 398 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CLMPQ9H6B4 373 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SCOCQ9UIL1 159 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ITM2BQ9Y287 266 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 A6NHS1 94 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC22BO75396 215 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 UMPSP11172 480 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 OPRD1P41143 372 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 MESP2Q0VG99 397 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 RUNX3Q13761 415 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC36Q1X8D7 754 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PROSER1Q86XN7 944 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 AADATQ8N5Z0 425 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SMRP1Q8NCR6 262 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SUSD6Q92537 303 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 HBEGFQ99075 208 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ACPTQ9BZG2 426 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 NANOGQ9H9S0 305 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PDYNP01213 254 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 C6P13671 934 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 HLA-EP13747 358 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 LIPEQ05469 1076 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 AAK1Q2M2I8 961 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 POM121L1PQ3SYA9 428 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 TJAP1Q5JTD0 557 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 VITQ6UXI7 678 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 FCRL1Q96LA6 429 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 YY1AP1Q9H869 796 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 CD207Q9UJ71 328 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 VEGFDO43915 354 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 LILRB5O75023 590 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNH1O95259 989 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 HSD3B1P14060 373 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 HSD3B2P26439 372 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PNLIPRP1P54315 467 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 HMGCS1Q01581 520 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF2H3Q13889 308 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms