RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 GPR83Q9NYM4 423 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 ARL5AQ9Y689 179 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXD8-202ENST00000429017 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ITPR2Q14571 2701 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF749O43361 778 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TNFRSF21O75509 655 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF1O95521 474 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 EPOP01588 193 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CBSLP0DN79 551 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TNNT1P13805 278 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DPA1P20036 260 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MSH3P20585 1137 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CDH3P22223 829 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PDHA2P29803 388 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CBSP35520 551 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GABRA4P48169 554 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 NCF4Q15080 339 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 POU4F3Q15319 338 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZIC1Q15915 447 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MED25Q71SY5 747 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PHC3Q8NDX5 983 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CHP1Q99653 195 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM5Q9C035 493 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 XKR8Q9H6D3 395 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GSAPA4D1B5 854 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 AGAP14A8MT82 685 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CCL22O00626 93 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CST8O60676 142 aa6.32□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.32□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 MARCKSL1P49006 195 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PCDH1Q08174 1060 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ITGA9Q13797 1035 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC38Q5VT99 294 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KAZNQ674X7 775 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PID1Q7Z2X4 250 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MRGPREQ86SM8 312 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CUZD1Q86UP6 607 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM73Q86UV7 250 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.32□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 CARFQ8N187 725 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.32□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HAUS1Q96CS2 278 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 APOL2Q9BQE5 337 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 FICDQ9BVA6 458 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ASB8Q9H765 288 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HACD3Q9P035 362 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IFNKQ9P0W0 207 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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