RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAPRTQ6XQN6 538 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL10Q6ZVT0 673 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNMB4Q86W47 210 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM20CQ8IXL6 584 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COG1Q8WTW3 980 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPSB2Q99619 263 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR54Q9H977 334 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC40Q9H9A6 602 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC23Q9UJX2 597 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOCS6O14544 535 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALBP02768 609 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR56A5P0C7T3 313 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXN2P32314 431 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB28P51157 221 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PER3P56645 1201 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKG7Q16617 165 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC34A3Q8N130 599 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRHL3Q8TE85 626 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND1AQ8TEH3 1009 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP4Q96P64 663 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALS2CR12Q96Q35 445 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL20Q9Y2M5 609 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51F1A6NGY5 319 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRTM2O43300 516 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TJP3O95049 919 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ONECUT2O95948 504 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDN3P14138 238 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMA3P25788 255 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARP6Q2NL67 630 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBB8Q3ZCM7 444 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX15Q7KZN9 410 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OVCH1Q7RTY7 1134 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJB14Q8TBM8 379 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNDP1Q96KN2 507 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC26A1Q9H2B4 701 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPS8L2Q9H6S3 715 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSGIN2Q9Y236 505 aa12.64□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MROH6A6NGR9 719 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSCR3O14972 297 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL18O95568 372 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RWDD2BP57060 319 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC16Q13042 620 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AADACL2Q6P093 401 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIRREL2Q6UWL6 708 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAX1BP1Q86VP1 789 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A15Q8IZD6 547 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01555Q8NAE3 123 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAR1Q8WVX9 515 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MENTQ9BUN1 341 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHPPQ9H008 270 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUTCQ9NTM9 273 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSFQ9UBX1 484 aa12.63□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC162PA2VCL2 907 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8W8V4 182 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1I1O60431 355 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S1PR4O95977 384 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCM3P25205 808 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CETN2P41208 172 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRM7Q14831 915 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLR1Q15399 786 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPA17Q15506 151 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBBP7Q16576 425 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P3H1Q32P28 736 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCRL6Q6DN72 434 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC170Q8IYT3 715 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TC2NQ8N9U0 490 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM71DQ8N9W8 422 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms