RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TAMM41Q96BW9 452 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL3Q9UH77 587 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NOTCH4Q99466 2003 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT9AO14904 365 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ODC1P11926 461 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CD52P31358 61 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD18Q0P651 414 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KEAP1Q14145 624 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCSK7Q16549 785 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CBLL1Q75N03 491 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT10Q86SR1 603 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF605Q86T29 641 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA11Q86U17 422 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP8Q86W28 1048 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPHS2Q99611 448 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM165Q9HC07 324 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 THEGQ9P2T0 379 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AURKCQ9UQB9 309 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ILVBLA1L0T0 632 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGPT2O15123 496 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ETHE1O95571 254 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TACR2P21452 398 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NR4A1P22736 598 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX18P35713 384 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGER3P43115 390 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP5AQ14642 412 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DDR2Q16832 855 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NXNQ6DKJ4 435 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 VASNQ6EMK4 673 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF135Q8IUD6 432 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf109Q9NX04 203 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT87PA6NCN2 255 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CREG1O75629 220 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GLP2RO95838 553 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00271P0C7V0 271 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMP24386 653 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GRK4P32298 578 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C21orf59P57076 290 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 STX1BP61266 288 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ10P78508 379 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NFYCQ13952 458 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PROX2Q3B8N5 592 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10A6Q8NH74 314 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SCYL1Q96KG9 808 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA17Q96L03 361 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NODALQ96S42 347 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF38Q9H0F5 515 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNH6Q9H252 994 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKMY1Q9P2S6 941 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CPA4Q9UI42 421 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPV2Q9Y5S1 764 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP33O14559 1287 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HBQ1P09105 142 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AOAHP28039 575 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP4F3Q08477 520 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EPS8Q12929 822 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF10Q12962 218 aa3.53□□□□□ -1.84
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