RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 MMP13P45452 471 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 NPBWR1P48145 328 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 UCP2P55851 309 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRAF2Q12933 501 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRKAA1Q13131 559 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 XKR9Q5GH70 373 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTOV1Q86YD1 416 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PGBD5Q8N414 524 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC13A3Q8WWT9 602 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TANKQ92844 425 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 MTBPQ96DY7 904 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHFRQ96EP1 664 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SGK494Q96LW2 274 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 C3orf30Q96M34 536 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PANX3Q96QZ0 392 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 P2RY12Q9H244 342 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q9H8V8 135 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMCC3Q9ULS5 477 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAF1P21675 1872 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 C5orf51A6NDU8 294 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNHIT1O43257 154 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNJ13O60928 360 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP9AO75110 1047 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALPPP05187 535 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALPPL2P10696 532 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 IRF2P14316 349 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYOD1P15172 320 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCNA2P20248 432 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIF5BP33176 963 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 GDF5P43026 501 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPC3P51654 580 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TGFB2P61812 414 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 BNC1Q01954 994 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDK1Q15118 436 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CALCRLQ16602 461 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CA9Q16790 459 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ELFN2Q5R3F8 820 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC38Q5VT99 294 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SUSD4Q5VX71 490 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 BTNL8Q6UX41 500 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 NLRP14Q86W24 1093 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD46Q86W74 232 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 AMIGO1Q86WK6 493 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSCBQ8IWL3 235 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 APCDD1Q8J025 514 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNNM3Q8NE01 707 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 FIG4Q92562 907 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSGA13Q96PP4 275 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR1F2PQ96R84 312 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 NEURL2Q9BR09 285 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCG4Q9H172 646 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 S1PR5Q9H228 398 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 GKN1Q9NS71 199 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 POT1Q9NUX5 634 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 SIX4Q9UIU6 781 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM17Q9Y577 477 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A0B4J203 849 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM149AA5PLN7 773 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 C5orf60A6NFR6 353 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPLX1O14810 134 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR1O75083 606 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms