RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 SEC16AO15027 2179 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 ARGFXA6NJG6 315 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 K7EM74 188 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 HCRTR1O43613 425 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 ESR1P03372 595 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CD63P08962 238 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 MLNP12872 115 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 OGNP20774 298 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 MAGP20916 626 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CCNFP41002 786 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 PTGIRP43119 386 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 VPS41P49754 854 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CTSL3PQ5NE16 218 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 TTC27Q6P3X3 843 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 RAB42Q8N4Z0 105 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 FOPNLQ96NB1 174 aa26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 MAGEB16A2A368 324 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 NR1D1P20393 614 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CYP1B1Q16678 543 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CPZQ66K79 652 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 MAGEC3Q8TD91 643 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 IL17FQ96PD4 163 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 GBP5Q96PP8 586 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 TXLNGQ9NUQ3 528 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 EURLQ9NYK6 297 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 SAMD15Q9P1V8 674 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 AVILO75366 819 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM63AO94886 807 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 C1orf105O95561 183 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CBSLP0DN79 551 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP5DP30049 168 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CBSP35520 551 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 DCDP81605 110 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CASC4Q6P4E1 433 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 RAB43Q86YS6 212 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 MCUQ8NE86 351 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 HMGCLL1Q8TB92 370 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 DENND1AQ8TEH3 1009 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 NDC1Q9BTX1 674 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC25A23Q9BV35 468 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 MLXIPLQ9NP71 852 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 IRAK4Q9NWZ3 460 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 GOLGA8KD6RF30 607 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 GOLGA8TH3BQL2 631 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 FMO4P31512 558 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 COILP38432 576 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 PGDP52209 483 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 FOXK1P85037 733 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CHAF1BQ13112 559 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 GBX1Q14549 363 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 SF1Q15637 639 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD22Q5VYY1 191 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 MED25Q71SY5 747 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 DLG3Q92796 817 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 MS4A14Q96JA4 679 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 IP6K3Q96PC2 410 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CIDEBQ9UHD4 219 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 NFS1Q9Y697 457 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CCL11P51671 97 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 TERF1P54274 439 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 RRADP55042 308 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM69BQ5VUD6 431 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 NEPROQ6NW34 567 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CILP2Q8IUL8 1156 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM20CQ8IXL6 584 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ZBTB2Q8N680 514 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 SDR42E2A6NKP2 422 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 NIPSNAP2O75323 286 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CEACAM4O75871 244 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 PDGFAP04085 211 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ARSFP54793 590 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 C1orf189Q5VU69 101 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 MLIPQ5VWP3 458 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 FIGLAQ6QHK4 219 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-203ENST00000407117 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms